- تجنيد طاقات جميع الأطباء والصيدلة ليؤدوا رسالة الطب والصيدلة، من أجل حل المشكلات الصحية لمقاتلي وأفراد الشعب الفلسطيني كافة، بحيث تصبح الرعاية الصحية، وقاية وعلاجاً، حقا لكل المقاتلين وأفراد الشعب.
- إجراء مسح طبي شامل للأمراض الشائعة في تجمعات الشعب الفلسطيني، ووضع البرامج الوقائية والعلاجية للقضاء على تلك الأمراض.
- توثيق العلاقات بالمنظمات الشعبية الفلسطينية، والتعاون لإبراز الوجود الفلسطيني، وتوطيد العلاقة مع المنظمات الصحية العربية والعالمية.
- تأكيد المفهوم الثوري لدى الفلسطينيين، وتعميق ارتباطهم بالحركة الثورية الفلسطينية والعربية والعالمية.
تنظيم العلاقة بين أعضاء الاتحاد والعاملين بالمهن الطبية الأخرى وتنمية روح التعاون والتجاوب العلمي والفني بينهم.
- تقديم كافة التسهيلات للنهوض بالمستوى العلمي لأعضاء الاتحاد وللعاملين بالمهن الطبية، وذلك بتشجيع الأبحاث وإصدار النشرات الدورية.
- الدفاع عن المصالح الاجتماعية والثقافية والمادية لأعضاء الاتحاد.
- تنوير الرأي العام بالقضية الفلسطينية عن طريق الاتصال بالأطباء والصيادلة والعاملين في المهن الطبية والتجمعات الطبية العالمية بواسطة الندوات والنشرات وبأي وسيلة أخرى.
- دعم جمعية الهلال الأحمر الفلسطيني بصفتها الجهاز الطبي المعتمد من المجلس الوطني الفلسطيني* لتقديم الخدمات الطبية والاجتماعية للمقاتلين والشعب الفلسطيني، وإمدادها بالأطباء والصيادلة.